Oprócz Irlandii Cypr jest jedynym państwem członkowskim UE, które nie należy do Schengen. Jego przypadek jest jednak wyjątkowy — od 1974 r. wyspa podzielona jest na Republikę Cypru zamieszkaną przez Greków i Turecką Republiką Cypru Północnego uznawaną jedynie przez Ankarę. Zdaniem urzędników UE członkostwo Cypru w Schengen mogłoby zwiększyć napięcia między dwoma częściami wyspy.